As atividades do ILSI Brasil são desenvolvidas por comitês científicos compostos por diferentes forças-tarefas (FTs). Cada FT é coordenada cientificamente por um representante da área acadêmica e um representante da área industrial, de expertise de atuação compatível à questão tratada pela FT. O ILSI Brasil possui três comitês e sete forças-tarefas.
[ILSI Brasil's programs are developed by scientific committees composed of different task forces. Each task force is coordinated by a representative from academia and from industry, each who have expertise in the task force's focus area. ILSI Brasil has three committees and seven task forces.]

Comitê de Avaliação do Risco (Risk Assessment Committee)
Comitê de Biotecnologia (Biotechnology Committee)
Comitê de Nutrição (Nutrition Committee)